2018年11月25日，第十一届中日韩卫生部长会议在日本熊本举行。国家卫生健康委主任马晓伟、日本和韩国卫生部长率团出席会议。来自中日韩三国卫生部门、世界卫生组织西太区和中日韩秘书处的代表约50余人参加了会议。 

会议交流了三国在突发急性传染病防控、全民健康覆盖和自然灾害卫生应急、慢性病防控和健康老龄化领域的做法和经验。三方同意，将进一步加强在上述领域的合作。会议通过了《联合声明》，并举行了新闻发布会。 

马晓伟指出，自2006年中日韩卫生合作机制建立以来，三国在卫生多个领域合作成果丰硕，为增进本地区人民健康福祉做出了积极贡献。他提出，中国“一带一路”倡议框架下卫生合作与中日韩卫生合作机制重点领域高度契合，愿三国进一步推进卫生合作协同发展。 

此访期间，马晓伟主任分别与日本厚生省劳动大臣根本匠、韩国保健福祉部长朴淩厚、世卫组织西太区主任申英秀举行双边会谈，会见了中日笹川医学合作项目两个日方合作单位负责人。马晓伟还参观了熊本市立医院。国家卫生健康委办公厅、应急办、医政医管局和国际司有关人员陪同此次访问。

马晓伟主任出席第十一届中日韩卫生部长会